برموفنول بلو مرک و سیگما

برمو فنل بلو به عنوان یک شناساگر رنگی به منظور بررسی فرآیند الکتروفورز ژل آگارز استفاده می شود . از آن جایی که برمو فنل بلو یک بار نسبتا منفی در pH متوسط حمل می کند ، در ژل در جهتی مشابه با DNA یا پروتئین حرکت می کند ، سرعت مهاجرت آن بستگی به چگالی ژل و ترکیب بافری دارد ، ولی در یک ژل آگارز معمول ۱ درصد و در یک بافر ۱X TEA یا بافر TBE ، برمو فنل بلو با سرعتی مشابه با قطعه ی DNA در حدود ۳۰۰ جفت باز مهاجرت می کند . زایلن سیانول و اورنج G نیز ممکن است برای این منظور استفاده شوند .

برموفنل بلو به عنوان یک رنگ نیز استفاده می شود . در pH خنثی ، این رنگ به شکل قوی تری نور قرمز را جذب می کند و نور آبی را انتقال می دهد . محلول های این رنگ بنابراین آبی رنگ می باشند . در pH پایین ، این رنگ نور ماورای بنفش و نور آبی را قوی تر جذب می کند و در محلول زرد رنگ به نظر می آید . در محلولی با pH 3.6 در وسط محدوده ی تغییر رنگ این شناساگر pH که توسط حل شدن در آب بدون تنظیم pH به دست می آید ، برمو فنل بلو دارای یک رنگ مشخص قرمز – سبز است که در آن تغییرات بارز رنگی وابسته به غلظت و / یا طول مسیری دارد که از میان آن محلول مشاهده می شود .