توانایی تشخیص گونه های باکتریایی به دلایل مختلفی از تشخیص عفونت یا بررسی ایمنی مواد غذایی گرفته تا مشخص کردن این گونه ها که یک ویژگی خارق العاده به پنیر می دهد ، مهم است. گونه های باکتریایی و حتی سویه های خاص را می توان با استفاده از تعدادی تکنیک مولکولی مانند PCR ، PCR کمی ، تعیین توالی ژنوم و طیف سنجی جرمی متمایز کرد. اما حتی بدون ورود به حیطه مولکولی، تفاوت های فنوتیپی بین گروه باکتری وجود دارد که می تواند برای تمایز آنها استفاده شود. این تفاوت ها شامل خصوصیاتی مانند شکل آنها (به عنوان مثال باسیل در مقابل کوکی ها)، رشد در مواد مغذی خاص و ترجیح به محیط های اکسیژن کم یا زیاد است. بسته به مشخصه مورد مطالعه، گونه های باکتریایی ممکن است به گروه های گسترده ای تقسیم شوند، اما با هم جمع شدن این اطلاعات می تواند هویت های احتمالی را بسیار محدود کند. یکی از این دسته بندی های مفید – اگر باکتری گرم گرم یا گرم منفی باشد – بر اساس ساختار دیواره های سلول باکتری است.

تفاوت در ساختار باکتریهای گرم مثبت و گرم منفی

نمودار زیر تفاوت در ساختار باکتریهای گرم مثبت و گرم منفی را نشان می دهد. دو ویژگی کلیدی که منجر به تفاوت خصوصیات تجسمی گونه های گرم مثبت و گرم منفی می شود ، ضخامت لایه پپتیدوگلیکان و وجود یا عدم وجود غشای چربی خارجی است. به این دلیل که ساختار دیواره بر توانایی سلول در حفظ لکه بنفش استفاده شده در روش رنگ آمیزی گرم تأثیر می گذارد و می توان آن را زیر میکروسکوپ نوری مشاهده کرد.

باکتریهای گرم مثبت و گرم منفی

S.N.	Characteristics	Gram Positive	Gram Negative
1	Gram Reaction	Retain crystal violet dye and stain blue or purple	Can be decolorized to accept counterstain (safranin) and stain pink or red
2	Cell Wall	Cell Wall is 20-30 nm thick.	Cell Wall is 8-12 nm thick.
3	Cell Wall	The wall is Smooth.	The wall is wavy.
4	Peptidoglycan Layer	Thick (multilayered)	Thin (single-layered)
5	Teichoic Acids	Present in many	Absent
6	Periplasmic Space	Absent	Present
7	Outer Membrane	Absent	Present
8	Porins	Absent	Occurs in Outer Membrane
9	Lipopolysaccharide (LPS) Content	Virtually None	High
10	Lipid and Lipoprotein Content	Low (acid-fast bacteria have lipids linked to peptidoglycan)	High (because of presence of outer membrane)
11	Mesosomes	Quite Prominent	Less Prominent
12	Flagellar Structure	2 rings in basal body	4 rings in basal body
13	Toxin Produced	Exotoxins	Endotoxins or Exotoxins
14	Resistance to Physical Disruption	High	Low
15	Cell Wall Disruption by Lysozyme	High	Low (requires pretreatment to destabilize outer membrane)
16	Susceptibility to Penicillin and Sulfonamide	High	Low
17	Susceptibility to Streptomycin, Chloramphenicol and Tetracycline	Low	High
18	Inhibition by Basic Dyes	High	Low
19	Susceptibility to Anionic Detergents	High	Low
20	Resistance to Sodium Azide	High باکتریهای گرم مثبت و گرم منفی	Low
21	Resistance to Drying	High	Low